Игорь, растение сидит в очень большом для такой крохи горшке, нужно прежде всего посмотреть его корни, так как если был хронический залив еще и при большом горшке большой шанс на то, что корневая не в порядке. Из-за этого растение нормально расти не будет.
Просто достать из горшка аккуратно и осмотреть, все гнилые и мертвые удалить, срезы припудрить толченым углем (можно активированным), и переместить его в горшок поменьше, добавив снизу дренаж и немного земли и с боков земли (аккуратно отряхнув землю, что отряхнется, не разрушая основного кома, оплетённого корнями).
Опрыскивание 3 раза в день это много.
На зеленых ветках даже без листьев есть почки, которые проснутся и тронутся в рост, поэтому обрезать нужно только засохшие побеги.
Цитрусы могут зимовать и при холодной и при теплой зимовке, только если она будет теплая - растению необходима досветка, при холодной они мирятся с недостатком естественного освещения.
Я бы его оставила на теплой, пока его состояние не улучшится. А в следующем году, если все хорошо, можно и на холодную определить.