Я на днях рассаживал два горшка с годовалыми сеянцами апельсина - в одном из косточки росли 2 побега, в другом - 3. Пришлось отмыть весь грунт в тазу и по одному распутывать почти каждый корешок. Не представляю, как это можно было сделать без отмывания грунта.
Если молодой прирост на верхних побегах вызрел, то можно и сейчас разделить. Чем меньше оборвется корней при пересадке, тем легче они ее перенесут.
Ветку у мелкого в 1 см от земли можно в любой момент обрезать.