Юлия, не вижу у вашего кумквата особых проблем, и паталогического почернения на фотографиях не вижу. Может, это естественное взросление ствола и соответственное изменение цвета? Если болото не просыхает, надо пересадить, при этом стряхните столько земли. сколько получится без ущерба для корней. Попутно посмотрите состояние корней, но если листопада нет, скорее всего они в порядке. Есть ещё вариант, кто-то предлагал здесь на форуме - горшок вынуть из поддона и поставить на стопку газет, чтоб воду впитали (или ком земли из горшка вынуть и газетами обмотать, если совсем дренаж забит - только не пересушите).
Александра, если листики в длину 3 см или меньше - 99%, что чинотто.